数据转换#
转换可让您处理和修改数据集。您可以组合转换来表达计算链。
注意
转换默认是惰性的。它们不会被执行,直到您通过迭代 Dataset、保存 Dataset 或检查 Dataset 属性 来触发数据消耗。
本指南将向您展示如何
转换行#
提示
如果您的转换是向量化的,请调用map_batches() 以获得更好的性能。要了解更多信息,请参阅转换批次。
使用 map 转换行#
如果您的转换对每个输入行返回正好一个行,请调用map()。
import os
from typing import Any, Dict
import ray
def parse_filename(row: Dict[str, Any]) -> Dict[str, Any]:
row["filename"] = os.path.basename(row["path"])
return row
ds = (
ray.data.read_images("s3://anonymous@ray-example-data/image-datasets/simple", include_paths=True)
.map(parse_filename)
)
传递给map()的用户定义函数应为Callable[[Dict[str, Any]], Dict[str, Any]] 类型。换句话说,您的函数应输入和输出一个字典,其中键是字符串,值是任何类型。例如
from typing import Any, Dict
def fn(row: Dict[str, Any]) -> Dict[str, Any]:
# access row data
value = row["col1"]
# add data to row
row["col2"] = ...
# return row
return row
使用 flat map 转换行#
如果您的转换对每个输入行返回多个行,请调用flat_map()。
from typing import Any, Dict, List
import ray
def duplicate_row(row: Dict[str, Any]) -> List[Dict[str, Any]]:
return [row] * 2
print(
ray.data.range(3)
.flat_map(duplicate_row)
.take_all()
)
[{'id': 0}, {'id': 0}, {'id': 1}, {'id': 1}, {'id': 2}, {'id': 2}]
传递给flat_map()的用户定义函数应为Callable[[Dict[str, Any]], List[Dict[str, Any]]] 类型。换句话说,您的函数应该输入一个字典,其中键是字符串,值是任何类型,并输出一个与输入具有相同类型的字典列表,例如
from typing import Any, Dict, List
def fn(row: Dict[str, Any]) -> List[Dict[str, Any]]:
# access row data
value = row["col1"]
# add data to row
row["col2"] = ...
# construct output list
output = [row, row]
# return list of output rows
return output
转换批次#
如果您的转换可以使用 NumPy、PyArrow 或 Pandas 操作进行向量化,则转换批次比转换单个行具有更高的性能。
from typing import Dict
import numpy as np
import ray
def increase_brightness(batch: Dict[str, np.ndarray]) -> Dict[str, np.ndarray]:
batch["image"] = np.clip(batch["image"] + 4, 0, 255)
return batch
ds = (
ray.data.read_images("s3://anonymous@ray-example-data/image-datasets/simple")
.map_batches(increase_brightness)
)
配置批次格式#
Ray Data 将批次表示为 NumPy ndarray、Pandas DataFrame 或 Arrow Table 的字典。默认情况下,Ray Data 将批次表示为 NumPy ndarray 的字典。要配置批次类型,请在map_batches() 中指定 batch_format。您可以从您的函数返回任何一种格式,但 batch_format 应与您函数的输入匹配。
在将转换应用于行批次时,Ray Data 可以将这些批次表示为 NumPy 的 ndarrays、Pandas DataFrame 或 PyArrow Table。
- 使用
batch_format=numpy时,函数的输入将是一个字典,其中键对应于列名,值对应于表示为ndarrays的列值。batch_format=pyarrow时,函数的输入将是一个 PyarrowTable。batch_format=pandas时,函数的输入将是一个 PandasDataFrame。
from typing import Dict
import numpy as np
import ray
def increase_brightness(batch: Dict[str, np.ndarray]) -> Dict[str, np.ndarray]:
batch["image"] = np.clip(batch["image"] + 4, 0, 255)
return batch
ds = (
ray.data.read_images("s3://anonymous@ray-example-data/image-datasets/simple")
.map_batches(increase_brightness, batch_format="numpy")
)
import pandas as pd
import ray
def drop_nas(batch: pd.DataFrame) -> pd.DataFrame:
return batch.dropna()
ds = (
ray.data.read_csv("s3://anonymous@air-example-data/iris.csv")
.map_batches(drop_nas, batch_format="pandas")
)
import pyarrow as pa
import pyarrow.compute as pc
import ray
def drop_nas(batch: pa.Table) -> pa.Table:
return pc.drop_null(batch)
ds = (
ray.data.read_csv("s3://anonymous@air-example-data/iris.csv")
.map_batches(drop_nas, batch_format="pyarrow")
)
用户定义的函数也可以是一个产生批次的 Python 生成器,因此函数也可以是 Callable[DataBatch, Iterator[[DataBatch]] 类型,其中 DataBatch = Union[pd.DataFrame, Dict[str, np.ndarray]]。在这种情况下,您的函数看起来会像
from typing import Dict, Iterator
import numpy as np
def fn(batch: Dict[str, np.ndarray]) -> Iterator[Dict[str, np.ndarray]]:
# yield the same batch multiple times
for _ in range(10):
yield batch
选择正确的批次格式#
为您的 map_batches 选择合适的批次格式时,主要考虑的是便利性与性能之间的权衡。
批次是底层块的滑动窗口:UDF 使用构成当前指定
batch_size的批次的底层块的行的子集进行调用。指定batch_size=None会使批次包含块中的所有行,形成一个批次。根据批次格式,这种视图可以是零拷贝(当批次格式与
pandas或pyarrow的块类型匹配时)或拷贝一次(当批次格式与块类型不同时)。
例如,如果底层块类型是 Arrow,指定 batch_format="numpy" 或 batch_format="pandas" 可能会在从底层块类型转换时引起底层数据的拷贝。
Ray Data 还致力于最小化数据转换量:例如,如果您的 map_batches 操作返回 Pandas 批次,那么这些批次将在不进行转换的情况下合并为块,并作为 Pandas 块进一步传播。大多数 Ray Data 数据源会产生 Arrow 块,因此使用批次格式 pyarrow 可以避免不必要的数据转换。
如果您希望使用更符合人体工程学的转换 API 但又想避免性能开销,可以考虑在您的 map_batches 操作中使用 polars,并设置 batch_format="pyarrow",如下所示
import pyarrow as pa
def udf(table: pa.Table):
import polars as pl
df = polars.from_pyarrow(table)
df.summary()
return df.to_arrow()
ds.map_batches(udf, batch_format="pyarrow")
配置批次大小#
增加 batch_size 可以提高向量化转换的性能以及模型推理的性能。但是,如果您的批次大小太大,您的程序可能会遇到内存不足(OOM)的错误。
如果您遇到 OOM 错误,请尝试减小您的 batch_size。
行的顺序#
在转换数据时,块的顺序默认不被保留。
如果需要保留/确定块的顺序,您可以使用 sort() 方法,或将 ray.data.ExecutionOptions.preserve_order 设置为 True。请注意,设置此标志可能会对较大的集群设置产生负面影响,因为在这些设置中,拖后腿的节点更可能出现。
import ray
ctx = ray.data.DataContext().get_current()
# By default, this is set to False.
ctx.execution_options.preserve_order = True
有状态转换#
如果您的转换需要昂贵的设置,例如下载模型权重,请使用可调用的 Python 类而不是函数来使转换具有状态。当使用 Python 类时,__init__ 方法会在每个工作节点上恰好调用一次以执行设置。相比之下,函数是无状态的,因此任何设置都必须为每个数据项执行。
内部来说,Ray Data 使用任务来执行函数,并使用 actor 来执行类。要了解更多关于任务和 actor 的信息,请阅读Ray Core 核心概念。
要使用 Python 类转换数据,请完成以下步骤
实现一个类。在
__init__中执行设置,并在__call__中转换数据。调用
map_batches()、map()或flat_map()。使用compute参数传递一个计算策略来控制 Ray 使用多少个工作节点。每个工作节点并行处理数据分区。使用ray.data.TaskPoolStrategy(size=n)来限制并发任务的数量,或使用ray.data.ActorPoolStrategy(...)在固定或自动缩放的 actor 池上运行可调用类。
from typing import Dict
import numpy as np
import torch
import ray
class TorchPredictor:
def __init__(self):
self.model = torch.nn.Identity()
self.model.eval()
def __call__(self, batch: Dict[str, np.ndarray]) -> Dict[str, np.ndarray]:
inputs = torch.as_tensor(batch["data"], dtype=torch.float32)
with torch.inference_mode():
batch["output"] = self.model(inputs).detach().numpy()
return batch
ds = (
ray.data.from_numpy(np.ones((32, 100)))
.map_batches(
TorchPredictor,
compute=ray.data.ActorPoolStrategy(size=2),
)
)
from typing import Dict
import numpy as np
import torch
import ray
class TorchPredictor:
def __init__(self):
self.model = torch.nn.Identity().cuda()
self.model.eval()
def __call__(self, batch: Dict[str, np.ndarray]) -> Dict[str, np.ndarray]:
inputs = torch.as_tensor(batch["data"], dtype=torch.float32).cuda()
with torch.inference_mode():
batch["output"] = self.model(inputs).detach().cpu().numpy()
return batch
ds = (
ray.data.from_numpy(np.ones((32, 100)))
.map_batches(
TorchPredictor,
# Two workers with one GPU each
compute=ray.data.ActorPoolStrategy(size=2),
# Batch size is required if you're using GPUs.
batch_size=4,
num_gpus=1
)
)
避免内存不足错误#
如果您的用户定义函数使用了大量内存,您可能会遇到内存不足的错误。为避免这些错误,请配置 memory 参数。它告诉 Ray 您的函数使用了多少内存,并防止 Ray 在节点上调度过多的任务。
def uses_lots_of_memory(batch: Dict[str, np.ndarray]) -> Dict[str, np.ndarray]:
...
# Tell Ray that the function uses 1 GiB of memory
ds.map_batches(uses_lots_of_memory, memory=1 * 1024 * 1024)
分组和转换组#
要转换组,请调用 groupby() 以根据提供的 key 列值对行进行分组。然后,调用 map_groups() 来对每个组执行转换。
from typing import Dict
import numpy as np
import ray
items = [
{"image": np.zeros((32, 32, 3)), "label": label}
for _ in range(10) for label in range(100)
]
def normalize_images(group: Dict[str, np.ndarray]) -> Dict[str, np.ndarray]:
group["image"] = (group["image"] - group["image"].mean()) / group["image"].std()
return group
ds = (
ray.data.from_items(items)
.groupby("label")
.map_groups(normalize_images)
)
import pandas as pd
import ray
def normalize_features(group: pd.DataFrame) -> pd.DataFrame:
target = group.drop("target")
group = (group - group.min()) / group.std()
group["target"] = target
return group
ds = (
ray.data.read_csv("s3://anonymous@air-example-data/iris.csv")
.groupby("target")
.map_groups(normalize_features)
)